根据《土地管理法实施条例》第七条之规定：“依照《土地管理法》的有关规定，收回用地单位的土地使用权的，由原土地登记机关注销土地登记。

土地登记

　　地使用权有偿使用合同约定的使用期限届满，土地使用者未申请续期或者虽申请续期未获批准的，由原土地登记机关注销土地登记。”。

　　由此可知，由原土地登记机关注销登记的情形有两种：第一，土地使用权被收回的;第二，土地使用权期限届满，土地使用者未申请续期或者申请续期未批准的。